Guanidiinvesinikkloriidi ja guanidiintiotsüanaadi mõju nukleiinhappe ekstraheerimisel

Nukleiinhapete ekstraheerimine viitab nukleiinhapete eraldamise protsessile proovidest füüsikaliste ja keemiliste meetoditega. Kvaliteetsete nukleiinhapete eraldamine on molekulaarbioloogia uuringute võtmesamm. Guanidiinvesinikkloriid ja guanidiini tiotsüanaat võivad denatureerida valke ja neid kasutatakse laialdaselt nukleiinhapete ekstraheerimiseks. Selles artiklis tutvustatakse guanidiinvesinikkloriidi ja guanidiintiotsüanaadi funktsioone nukleiinhapete ekstraheerimisel.

Guanidiinvesinikkloriid, CASi nr: 50-01-1, on valge kristalne pulber. Guanidiinvesinikkloriid on tugev nukleaasi inhibiitor, kuid see ei ole tugev denaturant. Selle peamine roll nukleiinhapete ekstraheerimisel on proteiini denatureerimine ja ensüümide aktiivsuse pärssimine. Guanidiinvesinikkloriid võib rakumembraani kiiresti hävitada ning valgu denatureerida ja sadestada, nii et nukleiinhape võib vabaneda valgu takerdumisest.

Guanidiintiotsüanaat, CASi nr: 593-84-0, on valge kristalne pulber. Guanidiintiotsüanaat on võimas valgu denaturant, millel puudub RNaasi ja DNaasi aktiivsus. Nukleiinhappe ekstraheerimisel võib guanidiintiotsüanaat kiiresti rakke või viirusi murda, et vabastada nukleiinhape, pärssida rakkude poolt vabanevat nukleaasi ja tagada nukleiinhappe primaarse struktuuri terviklikkus.

Guanidiinvesinikkloriid ja guanidiintiotsüanaat on tavalised guanidiinisoolad nukleiinhappe ekstraheerimise lüsaatides. Nad ei saa mitte ainult pakkuda kõrge soolasisaldusega keskkonda, vaid ka inaktiveerida nukleaasi, vabastada nukleiinhapet ja kaitsta nukleiinhappe molekule.